この車両は京葉線の老朽化した２０１系などを置き換える目的として1編成が試験的に導入された。
基本的に京葉線内の土休日みの運用で、外房線内での運用はまだないが、試運転時には
外房線内（最長で台東まで）の試運転を何回も実施していたので、これから将来的には外房線快速として運用に入るかもしれません。
ＪＲでは初の連接台車を採用している。
車軸直接駆動式電動機（ＤＤＭ）を採用している
編成14両で構成されており、7両の連接編成を2本組み合わせることにより、編成の長さは既存車両（20m車）の10両編成と同一になる。そのため、検査などの時は連接編成を分割して行うことがある。
一般的に量産先行車と言うのは900番台がつく車両の事をいいますが、このＥ331系は900番台ではないのです！！ですが、ＪＲ東日本の車両図鑑にはなぜか量産先行車と表記されていました。
Ｅ３３１系の量産先行車はＥ９９３系（ＡＣトレイン）です。
2007年から2010年（平成22年）までの3年間にわたり、京葉線で営業運転を兼ねながらの試験走行を行い、DDMや連接台車化によるメリット（検査面・コスト面）を調査し、量産に踏み切るかを判断する予定である。したがって、今後の増備計画についての発表はされていない。

備考
部品の一部について改良を行うことから、当面の間運転休止いたします。運行再開時期は、現時点で未定です
と、千葉支社のホームページにかかれていました。
先日、７両が川崎重工に甲種回送されて、部品の改良を受け、京葉車両センターまで回送されました。
が・・・しかし、Ｅ３３１系は、ず〜〜っと京葉車両センターに留置されており試運転も実施されていない模様・・・



設計最高速度
１２０ｋm/h

最高速度
１００ｋm/h（おそらく外房線内では１１０ｋm/h）

定員
14両で1,480人

制御装置
ＶＶＶＦインバータ制御

ブレーキ方式
回生併用電気指令式空気ブレーキ

製造メーカー
川崎重工　東急車輛　１４両の７両ずつ製作

保安装置
ＡＴＳ-ＳＮ　ＡＴＳ-Ｐ

使用体系
１４両　【１両の長さが短い１４両編成（従来車両の１０両編成と同じ編成長）】
運行形態
土休日のみの運用「東京」⇔「蘇我」　※今のところ外房線内での運用はない
平日は混乱を避けるために運用はない
運行種別
各駅停車　快速